MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589 chromosome

Total Repeats: 40002

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013522	GTG	2	6	94	99	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791620
2	NC_013522	C	6	6	178	183	0 %	0 %	0 %	100 %	269791620
3	NC_013522	GCG	2	6	187	192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791620
4	NC_013522	CGG	2	6	231	236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791620
5	NC_013522	TGCTGG	2	12	239	250	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	269791620
6	NC_013522	TCC	2	6	293	298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269791620
7	NC_013522	GGA	2	6	336	341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791620
8	NC_013522	AGA	2	6	383	388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269791620
9	NC_013522	GCG	2	6	397	402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791620
10	NC_013522	GTG	2	6	463	468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791620
11	NC_013522	GGC	3	9	504	512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791620
12	NC_013522	TGGGG	3	15	550	564	0 %	20 %	80 %	0 %	269791620
13	NC_013522	GGT	2	6	630	635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791620
14	NC_013522	AAC	2	6	685	690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269791620
15	NC_013522	CGA	2	6	741	746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269791620
16	NC_013522	AGG	2	6	779	784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791620
17	NC_013522	AAG	2	6	820	825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269791620
18	NC_013522	GGT	2	6	828	833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791620
19	NC_013522	C	6	6	850	855	0 %	0 %	0 %	100 %	269791620
20	NC_013522	GGA	2	6	873	878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791620
21	NC_013522	AGA	2	6	959	964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269791620
22	NC_013522	TCT	2	6	1004	1009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269791620
23	NC_013522	GTG	2	6	1066	1071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791620
24	NC_013522	CGC	2	6	1113	1118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269791620
25	NC_013522	TGG	2	6	1187	1192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791620
26	NC_013522	CTG	2	6	1222	1227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269791620
27	NC_013522	CAGG	2	8	1260	1267	25 %	0 %	50 %	25 %	269791620
28	NC_013522	CAG	2	6	1309	1314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269791620
29	NC_013522	CAA	2	6	1329	1334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269791620
30	NC_013522	CAC	2	6	1344	1349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269791620
31	NC_013522	GAA	2	6	1428	1433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269791620
32	NC_013522	CCT	2	6	1771	1776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269791621
33	NC_013522	TCC	2	6	1794	1799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269791621
34	NC_013522	GCT	2	6	1889	1894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269791621
35	NC_013522	AAG	2	6	1923	1928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269791621
36	NC_013522	GAG	2	6	1959	1964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791621
37	NC_013522	CCGG	2	8	1984	1991	0 %	0 %	50 %	50 %	269791621
38	NC_013522	ACG	2	6	2014	2019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269791621
39	NC_013522	CTC	2	6	2042	2047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269791621
40	NC_013522	CTC	2	6	2246	2251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269791621
41	NC_013522	TGC	2	6	2263	2268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269791621
42	NC_013522	AGG	2	6	2317	2322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791621
43	NC_013522	CCAGGC	2	12	2348	2359	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	269791621
44	NC_013522	CGA	2	6	2372	2377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269791621
45	NC_013522	CAC	2	6	2447	2452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269791621
46	NC_013522	GAT	2	6	2477	2482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269791621
47	NC_013522	TGG	2	6	2506	2511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791621
48	NC_013522	CAA	2	6	2522	2527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	269791621
49	NC_013522	TGG	2	6	2530	2535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791621
50	NC_013522	GAG	2	6	2570	2575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791621
51	NC_013522	GGA	2	6	2603	2608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791621
52	NC_013522	TCC	2	6	2662	2667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269791621
53	NC_013522	CCT	2	6	2771	2776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269791621
54	NC_013522	TCAA	2	8	2830	2837	50 %	25 %	0 %	25 %	269791622
55	NC_013522	TA	3	6	2840	2845	50 %	50 %	0 %	0 %	269791622
56	NC_013522	GGA	2	6	2859	2864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791622
57	NC_013522	TTC	2	6	2899	2904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269791622
58	NC_013522	CGGGG	2	10	2913	2922	0 %	0 %	80 %	20 %	269791622
59	NC_013522	CCT	2	6	2931	2936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269791622
60	NC_013522	GCC	2	6	2950	2955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269791622
61	NC_013522	G	7	7	2963	2969	0 %	0 %	100 %	0 %	269791622
62	NC_013522	TCCCCT	2	12	3010	3021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269791622
63	NC_013522	CCG	2	6	3026	3031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269791622
64	NC_013522	GAG	3	9	3052	3060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791622
65	NC_013522	GCT	2	6	3093	3098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269791622
66	NC_013522	GCC	2	6	3175	3180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269791622
67	NC_013522	TGG	2	6	3182	3187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791622
68	NC_013522	GCC	2	6	3192	3197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269791622
69	NC_013522	GGC	2	6	3206	3211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791622
70	NC_013522	CGG	2	6	3274	3279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791622
71	NC_013522	GAG	2	6	3322	3327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791622
72	NC_013522	CCT	2	6	3449	3454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269791622
73	NC_013522	GCC	2	6	3508	3513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269791622
74	NC_013522	GAG	2	6	3529	3534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791622
75	NC_013522	CGG	2	6	3602	3607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791622
76	NC_013522	AGG	2	6	3631	3636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791622
77	NC_013522	CGC	2	6	3645	3650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269791622
78	NC_013522	GGT	2	6	3672	3677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791622
79	NC_013522	GGT	2	6	3858	3863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791622
80	NC_013522	G	6	6	3874	3879	0 %	0 %	100 %	0 %	269791622
81	NC_013522	TGG	3	9	3920	3928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791623
82	NC_013522	G	6	6	3927	3932	0 %	0 %	100 %	0 %	269791623
83	NC_013522	GGC	2	6	3951	3956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791623
84	NC_013522	CTG	2	6	3988	3993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269791623
85	NC_013522	G	6	6	4089	4094	0 %	0 %	100 %	0 %	269791623
86	NC_013522	GGC	2	6	4107	4112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791623
87	NC_013522	TCC	2	6	4250	4255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269791623
88	NC_013522	AGGCGG	2	12	4256	4267	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	269791623
89	NC_013522	GGA	2	6	4281	4286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791623
90	NC_013522	G	6	6	4298	4303	0 %	0 %	100 %	0 %	269791623
91	NC_013522	GGT	2	6	4323	4328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791623
92	NC_013522	CT	3	6	4348	4353	0 %	50 %	0 %	50 %	269791623
93	NC_013522	AGG	2	6	4544	4549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791623
94	NC_013522	GAG	3	9	4552	4560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791623
95	NC_013522	TCT	2	6	4577	4582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269791623
96	NC_013522	GTG	2	6	4594	4599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791623
97	NC_013522	CTT	2	6	4605	4610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269791623
98	NC_013522	GTCC	2	8	4718	4725	0 %	25 %	25 %	50 %	269791623
99	NC_013522	GGT	2	6	4737	4742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791623
100	NC_013522	CGT	2	6	4829	4834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269791623
101	NC_013522	ACG	2	6	4841	4846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269791623
102	NC_013522	CTGG	2	8	4953	4960	0 %	25 %	50 %	25 %	269791623
103	NC_013522	GAG	2	6	5020	5025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791623
104	NC_013522	TGG	2	6	5042	5047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791623
105	NC_013522	CGA	2	6	5133	5138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269791623
106	NC_013522	CGA	2	6	5157	5162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269791623
107	NC_013522	GAC	2	6	5266	5271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269791623
108	NC_013522	GTG	2	6	5284	5289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791623
109	NC_013522	GGA	2	6	5301	5306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791623
110	NC_013522	GTGGAG	2	12	5503	5514	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	269791623
111	NC_013522	CGG	2	6	5548	5553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791623
112	NC_013522	G	6	6	5739	5744	0 %	0 %	100 %	0 %	269791623
113	NC_013522	GTGAG	2	10	5791	5800	20 %	20 %	60 %	0 %	269791624
114	NC_013522	GAG	2	6	5853	5858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791624
115	NC_013522	CGT	2	6	5881	5886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269791624
116	NC_013522	TCT	2	6	5900	5905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269791624
117	NC_013522	GGT	2	6	5906	5911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791624
118	NC_013522	CTC	2	6	5921	5926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269791624
119	NC_013522	GAT	3	9	5939	5947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269791624
120	NC_013522	AAG	2	6	5952	5957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269791624
121	NC_013522	TGG	2	6	5965	5970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791624
122	NC_013522	GGA	2	6	5996	6001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791624
123	NC_013522	GGT	2	6	6011	6016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791624
124	NC_013522	GCG	2	6	6022	6027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791624
125	NC_013522	GTC	2	6	6056	6061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269791624
126	NC_013522	GGCCCC	2	12	6079	6090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269791624
127	NC_013522	G	6	6	6190	6195	0 %	0 %	100 %	0 %	269791624
128	NC_013522	GGC	2	6	6926	6931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791625
129	NC_013522	GCG	2	6	6934	6939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791625
130	NC_013522	TGCG	2	8	6968	6975	0 %	25 %	50 %	25 %	269791625
131	NC_013522	C	6	6	6979	6984	0 %	0 %	0 %	100 %	269791625
132	NC_013522	ACT	2	6	7000	7005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269791625
133	NC_013522	TG	3	6	7090	7095	0 %	50 %	50 %	0 %	269791625
134	NC_013522	GGTCC	2	10	7118	7127	0 %	20 %	40 %	40 %	269791625
135	NC_013522	GGC	2	6	7244	7249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791625
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138	NC_013522	GCC	2	6	7285	7290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269791625
139	NC_013522	GTG	2	6	7305	7310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791625
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158	NC_013522	G	6	6	8283	8288	0 %	0 %	100 %	0 %	269791626
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161	NC_013522	A	6	6	8649	8654	100 %	0 %	0 %	0 %	269791627
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164	NC_013522	CAC	2	6	8790	8795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269791627
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167	NC_013522	GGA	2	6	9228	9233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791627
168	NC_013522	GTG	2	6	9322	9327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791627
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253	NC_013522	C	6	6	13882	13887	0 %	0 %	0 %	100 %	269791630
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259	NC_013522	CTG	2	6	14287	14292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269791631
260	NC_013522	CCA	2	6	14418	14423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269791631
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262	NC_013522	CGA	2	6	14595	14600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269791631
263	NC_013522	CAC	2	6	14604	14609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269791631
264	NC_013522	GAA	2	6	14661	14666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269791631
265	NC_013522	GTG	2	6	14710	14715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791631
266	NC_013522	GTG	2	6	14734	14739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791631
267	NC_013522	GGT	2	6	14757	14762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791631
268	NC_013522	GGA	2	6	14763	14768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791631
269	NC_013522	GGACCG	2	12	14850	14861	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	269791631
270	NC_013522	CCG	2	6	14906	14911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269791631
271	NC_013522	GTG	2	6	14956	14961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791631
272	NC_013522	C	6	6	14968	14973	0 %	0 %	0 %	100 %	269791631
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275	NC_013522	GGT	2	6	15120	15125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791632
276	NC_013522	TGG	2	6	15188	15193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791632
277	NC_013522	ACC	3	9	15214	15222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269791632
278	NC_013522	AGG	2	6	15302	15307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791632
279	NC_013522	CGG	2	6	15322	15327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791632
280	NC_013522	ACC	2	6	15413	15418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269791632
281	NC_013522	CGG	2	6	15519	15524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791632
282	NC_013522	CGA	2	6	15585	15590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269791632
283	NC_013522	GGT	2	6	15699	15704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791632
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285	NC_013522	CTT	2	6	15774	15779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	269791632
286	NC_013522	CTC	2	6	15811	15816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	269791632
287	NC_013522	CGA	2	6	15954	15959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269791632
288	NC_013522	G	7	7	15978	15984	0 %	0 %	100 %	0 %	269791632
289	NC_013522	ATG	2	6	16130	16135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269791633
290	NC_013522	G	7	7	16157	16163	0 %	0 %	100 %	0 %	269791633
291	NC_013522	ATC	2	6	16191	16196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	269791633
292	NC_013522	GTGG	2	8	16219	16226	0 %	25 %	75 %	0 %	269791633
293	NC_013522	CCG	2	6	16230	16235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269791633
294	NC_013522	GGA	2	6	16246	16251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791633
295	NC_013522	A	6	6	16297	16302	100 %	0 %	0 %	0 %	269791633
296	NC_013522	GCAA	2	8	16346	16353	50 %	0 %	25 %	25 %	269791633
297	NC_013522	GTG	2	6	16405	16410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791633
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300	NC_013522	CTG	2	6	16547	16552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269791633
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330	NC_013522	TGG	2	6	18281	18286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791635
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334	NC_013522	GA	3	6	18470	18475	50 %	0 %	50 %	0 %	269791635
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343	NC_013522	GGC	2	6	19078	19083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791635
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360	NC_013522	GA	3	6	19935	19940	50 %	0 %	50 %	0 %	269791636
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371	NC_013522	AG	3	6	20545	20550	50 %	0 %	50 %	0 %	269791637
372	NC_013522	GGC	2	6	20595	20600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791637
373	NC_013522	GCG	2	6	20616	20621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269791637
374	NC_013522	GGTG	2	8	20658	20665	0 %	25 %	75 %	0 %	269791637
375	NC_013522	GGGTT	2	10	20756	20765	0 %	40 %	60 %	0 %	269791637
376	NC_013522	GGA	2	6	20823	20828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791637
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378	NC_013522	GCC	2	6	20915	20920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269791637
379	NC_013522	TA	3	6	20935	20940	50 %	50 %	0 %	0 %	269791637
380	NC_013522	CAAGG	2	10	21036	21045	40 %	0 %	40 %	20 %	269791637
381	NC_013522	GGT	2	6	21057	21062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791637
382	NC_013522	GTG	2	6	21223	21228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791637
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384	NC_013522	AAGAT	2	10	21301	21310	60 %	20 %	20 %	0 %	269791637
385	NC_013522	GAG	2	6	21340	21345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	269791637
386	NC_013522	GGT	2	6	21365	21370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269791637
387	NC_013522	G	6	6	22951	22956	0 %	0 %	100 %	0 %	269791638
388	NC_013522	GGTA	2	8	22961	22968	25 %	25 %	50 %	0 %	269791638
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